Milí kolegové a kolegyně,
chtěli bychom vás srdečně pozvat na další přednášku semináře, která se koná již zítra, tj. ve středu 8.3.2017, od 17:20 v posluchárně S5.
Hostem na semináři bude Lukáš Hrbek z FIT ČVUT a téma přednášky bude
Variant calling with deep neural networks
Těšíme se srdečně na vaši účast!
Za všechny organizátory semináře s pozdravem, Petr Daněček
Stránky semináře http://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/
--------------------------------------
Lukáš Hrbek Variant calling with deep neural networks
Variant calling is the task of determining differences in individuals genomes. Due to limitations of DNA sequencing technologies, variant calling is most reliable for small sequence differences (single nucleotide variations and to a lesser extent insertions and deletions smaller than 50bp). Moreover, at least 10% of the genome still remains inaccessible, mainly because of high number of repetitive elements interspersed throughout the genome.
I will present two recent papers which employ a novel approach to the variant calling problem.