Dear all,

the next seminar will take place tomorrow, please see the details below. We look forward to seeing you all!

Title: MolMeDB - databáze interakcí malých molekul s membránami a membránovými transportními proteiny
Speaker: Kateřina Storchmannova (Palacký University Olomouc)

Date and time: Wednesday19/4/2023 - 17:20
Location: MFF UK, Malostranské nám. 25, lecture hall S4
https://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/

Best wishes,
Petr Danecek

-------------------------------

Kateřina Storchmannova (Palacký University Olomouc)
MolMeDB - databáze interakcí malých molekul s membránami a membránovými transportními proteiny

Biologické membrány jsou přirozenými bariérami buněk a některých buněčných organel. Jako takové hrají důležitou roli ve farmakokinetice a farmakodynamice léčiv a dalších xenobiotik. K určení interakcí mezi molekulami a membránami se používá řada experimentálních i teoretických přístupů, ale neexistoval žádný otevřený zdroj těchto dat. Z tohoto důvodu jsme vytvořili databázi MolMeDB (Molecule on Membrane Database), která shromažďuje údaje o interakcích pro více než 500 000 molekul s membránami či membránovými transportními proteiny. Informace o interakcích byly shromážděny z vědeckých článků publikovaných v recenzovaných časopisech, z in-house výpočtů či z databází. MolMeDB může být mocným nástrojem, který může pomoci experimentátorům i teoretikům pomoci lépe pochopit chování látek na membránách.