Milí kolegové a kolegyně,
chtěli bychom vás srdečně pozvat na další přednášku semináře, která se koná ve středu 14.12.2016, od 17:20 v posluchárně S5.
Hostem na semináři bude Jiří Macas z Ústavu Molekulární Biologie Rostlin AV ČR a téma přednášky bude
Repetitivní DNA: "Temná hmota" genomu a její výzkum pomocí teorie grafů
Těšíme se srdečně na vaši účast!
Za všechny organizátory semináře s pozdravem, Petr Daněček
Stránky semináře http://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/
--------------------------------------
Jiří Macas Repetitivní DNA: "Temná hmota" genomu a její výzkum pomocí teorie grafů
Repetitivní DNA je souhrnný pojem pro různorodé sekvence, které se v genomu vyskytují v desitkách až miliónech kopií. Přestože u některých druhů rostlin a živočichů tvoří až 95% jaderné DNA, je o složení a evoluci repetitivní DNA u většiny skupin organizmů známo jen velmi málo. Tato situace se v současnosti mění díky zavedení levných a vysoce účinných metod sekvenování (next generation sequencing, NGS), jejichž plné uplatnění je ale limitováno nedostatkem odpovídajicích bioinformatických nástrojů. Využití teorie grafů v analýze NGS dat však otevřelo nové cesty jak pro identifikaci různých typů repetitivních elementů v komplexních genomech rostlin a živočichů, tak pro jejich podrobnou charakterizaci a srovnávací analýzu složení repetic mezi různými druhy.