Milí kolegové a kolegyně,
chtěli bychom vás srdečně pozvat na další přednášku semináře, která se
koná zítra, tj. ve středu 1.11.2017, od 17:20 v posluchárně S4.
Hostem na semináři bude Martin Modrák z Laboratoře bioinformatiky,
Mikrobiologický ústav AV ČR, a téma přednášky bude
Genexpi: Discovering Regulatory Interactions on the GPU
Těšíme se srdečně na vaši účast!
Za všechny organizátory semináře s pozdravem,
Petr Daněček
Stránky semináře
http://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/
--------------------------------------
Martin Modrák
Genexpi: Discovering Regulatory Interactions on the GPU
The talk will discuss a differential equation model of transcription
factor-gene interactions that allows us to infer regulatory
relationships from time series data of gene expression in cells. The
talk will focus on both theoretical foundations of the work as well as
the implementation of the model on the GPU and practical evaluation.
Milí kolegové a kolegyně,
chtěli bychom vás srdečně pozvat na první přednášku semináře v tomto
semestru, která se koná již zítra, tj. ve středu 18.10.2017, od 17:20 v
posluchárně S4.
Hostem na semináři bude David Dufour Rausell z University of Barcelona
a téma přednášky bude
A brief overview of Structural Bioinformatics: from proteins to
chromosomes
Těšíme se srdečně na vaši účast!
Za všechny organizátory semináře s pozdravem,
Petr Daněček
Stránky semináře
http://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/
--------------------------------------
David Dufour Rausell
A brief overview of Structural Bioinformatics: from proteins to
chromosomes
In recent years we have been witness of an explosion in the field of
genomics and metagenomics, where the order of magnitude of the genomes
studied increases steadily, as well as the methods for analysing them
become more sophisticated. But there is another side of bioinformatics
that keeps being developed in a more discreet way. How structurally
similar are the proteins in a cell? Can we predict the shape of a
protein that can’t be studied by X-ray crystallography or NMR? Is it
possible to integrate different data sources to determine the shape of
the chromatin? Structural bioinformatics aims to give an answer to
these questions. It is my goal to provide a non-comprehensive overview
of its methods and possibilities in the current seminar.