November 2016 - Bioinf-l - kam.mff.cuni.cz

pozvanka na seminar
by Petr Danecek 28 Nov '16

28 Nov '16

Milí kolegové a kolegyně, chtěli bychom vás srdečně pozvat na další přednášku semináře, která se koná ve středu 30.11.2016, od 17:20 v posluchárně S5. Hostem na semináři bude Milan Malinský z WTSI UK a téma přednášky bude "Bioinformatické metody a aplikace v evoluční genomice" Těšíme se srdečně na vaši účast! Za všechny organizátory semináře s pozdravem, Petr Daněček Stránky semináře http://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/ -------------------------------------- Bioinformatic methods and insights in evolutionary genomics Milan Malinsky, PhD Computational analysis of genomic data is used more and more often to provide increasingly important and often unique insights about the amazing history of life on Earth. In this presentation I am first going to talk about some of the technical aspects with particular focus on genome assembly and population structure inference, including some of my work on these subjects. In the second half of the presentation I am going to discuss work on unravelling the molecular basis of evolutionary processes leading to adaptation and organismal diversity in East African cichlid fishes, the most species rich and diverse family of vertebrates on Earth, with thousands of species in lakes and rivers across sub-saharan Africa.

1 0

Compeau-Pevzner Bioinformatic algorithms
by Ales Kubena 24 Nov '16

24 Nov '16

přátelé bionerdi, zájemci (nezájemcům se omlouvám za nevyžádaný mail) dostal jsem od vědeckého Ježíška co chodí v listopadu Bioinformatic Algorithms I+II, Phillip Compeau & Pavel Pevzner. Tak kdyby někdo chtél kouknout či si něco z toho okopírovat, může se mi ozvat. Můžete to zkusit také oficiální cestou přes Knihovnu vědeckých informací lf1 a vfn, ale stejně vás pošlou za mnou a já to mám půjčené do roku 2022 ;) Pěkný den přeji @leš Kuběna

1 0

pozvánka na p?edná?ku
by Petr Danecek 14 Nov '16

14 Nov '16

Milí kolegové a kolegyně, chtěli bychom vás srdečně pozvat na další přednášku semináře, která se koná ve středu 16.11.2016 od 17:20 v posluchárně S5. Hostem na semináři bude Dr. Michal Kolář z Ústavu molekulární genetiky AV ČR a téma přednášky bude "Evoluce zachycená v (proteinové) síti" Těšíme se srdečně na vaši účast! Za všechny organizátory semináře s pozdravem, Petr Daněček Stránky semináře http://bioinformatika.mff.cuni.cz/seminar/ -------------------------------------- Evolution captured by a (protein) network Michal Kolar, PhD Sequence alignment is a prolific basis of functional annotation, but remains a challenging problem in the 'twilight zone' of high sequence divergence or short gene length. I will demonstrate how information on protein interactions can help to resolve ambiguous sequence alignments. This hybrid method - graph alignment - provides functional associations between proteins of the two organisms that cannot be obtained from sequence or interaction data alone. As a case study I will discuss comparison of two distant Herpes viruses.

1 0